医学生物信息学公共数据深度挖掘临床应用培训班
各企事业单位、高等院校及科研院所：
         当前，我国临床医学数据资源丰富，但很多医学数据资源并未充分利用，医学数据资源也未能充分解读，造成医院医学数据资源利用率低。然而，一系列问题基础诸问题对于广大医务工作者来说，是影响其进一步学习和科研应用的瓶颈。
没有实验怎么发表论文？
手头有很多数据，不知道该怎么进一步挖掘？
如何找靶点？
不精通挖掘GEO、TCGA等数据库怎么办？
怎样才能做出高大上的医学图表？
          工业与信息化技术培训网（http://www.itcc.ac.cn ）特举办“医学生物信息学公共数据深度挖掘临床应用培训班”。本次培训通过临床科研思路设计、医学统计分析和生物信息学在医学领域的应用培训，提高医生的科研设计及数据分析能力，提升医学资源利用率。
一、培训目标：
    1，短、平、快，为基金申请保驾护航，发表paper如虎添翼；
    2，掌握多组学数据分析核心技能，GEO、TCGA、SRA数据处理没有压力；
    3，科研绘图：以一敌百，高端大气，私人订制；
    4，一套数据多角度演练，更易掌握分析思路。
二、主讲专家：
来自重点高校及科研单位等医学生物信息学学科带头人、擅长各类型医学数据统计分析、生物医学大数据挖掘及生物信息学分析。发表数十篇篇专业领域内学术论文，近年发表专业领域SCI论文10余篇，主编或参与编写多部著作。参与多家三甲医院临床生物信息学的研究合作，科研及授课经验很丰富。
三、培训时间:
     2021年10月21日— 2021年10月24日   远程在线培训
          （第一天数据及操作软件调试，共授课三天）
四、参加对象：
从事生物医学研究的临床医生、转化研究科研人员；
课题经费不足，无法进行大规模测序，但需要发表SCI论文的相关研究人员；
已获得转录组、基因组等多组学数据，需要进一步挖掘分析人员；
对生物医学大数据分析与挖掘感兴趣的其他人员。
五、课程大纲

一、公共数据库挖掘热点介绍	1、疾病诊断biomarker鉴定 2、疾病预后biomarker鉴定 3、可变剪切与预后相关分析 4、肿瘤免疫分析 5、多组学泛癌症分析 6、人工智能研究在病理切片识别上的应用 7、人工智能多组学数据整合分析
二、常用生物医学数据库介绍	1、用生物医学数据库介绍： 1）大型综合数据库：NCBI、UCSC 2）公共高通量测序数据库：SRA 3）公共基因表达谱数据库：GEO 4）公共癌症多组学数据库：TCGA 2、各大数据库数据下载
三、R语言基础 （上机操作及案例分析）	1、R语言简介 2、R语言安装及配置 3、R语言数据结构 4、R语言数据处理 5、R语言绘图
四、基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练（一）	1、差异表达分析及结果可视化： 1）edgeR包使用 2）火山图绘制 3）聚类热图绘制 2、GO、KEGG功能富集分析及结果可视化： 1）GO富集分析 2）KEGG富集分析 3）富集分析气泡图绘制
五、基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练（二）	1、利用string数据库查询基因/蛋白相互作用 2、利用cytoscape工具构建相互作用网络 3、网络拓扑结构分析、关键基因识别
六、基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练（三）	预后相关性分析、生存曲线、ROC曲线绘制： 1）利用R包进行单因素及多因素预后分析 2）生存曲线绘制、生存曲线差异显著性分析 3）RISK score计算及结果可视化
七、多组学数据联合分析演练（一）	甲基化与转录组整合分析思路演练 1）甲基化数据预处理 2）差异甲基化位点及区域识别 3）甲基化与转录组数据联合分析 4）公共表观数据库：ENCODE、regulomeDB
八、多组学数据联合分析演练（二）	lncRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练 1）lncRNA表达谱数据获取 2）miRNA靶基因分析 3）lncRNA与mRNA表达相关性分析 4）ceRNA网络构建及结果可视化
九、辅助课程	1.学后交流、微信群、QQ群建立； 2.咨询、合作。专业技术团队深入探讨。

八、培训费用：
    每人4200元（含培训费、教材费、证书费、资料费、课后指导答疑费）
   （注：可转账、公务卡扫码支付。正规会议通知、发票。）
九、联系方式：
联系人:  期 涛（老师）            手机（微信同号）：15210196261
电话：010-56129268                官方咨询QQ：513692711
E_mail：cashq_ict@vip.163.com     工业与信息化培训网：http://www.itcc.ac.cn

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