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【第二期】临床医学公共平台NHANES、SEER、MIMIC数据库 SCI实战应用培训班

用公共数据库发文章已经成为国人发文的重要方式,因为对临床医生来说,临床太忙,科研压力山大,每天在医院里连轴转,没法做实验,收集数据过程繁琐、工作量大,又必须要发与自己科室相关、临床研究类的SCI。缺数据、缺方法、不会统计运用、无人指引?

为什么有些医生的SCI发得那么顺利?

发表论文也有诀窍:充分利用临床公共数据库。

利用公共数据库写论文,已经成为毕业、升职称、年度绩效考核的重要方法。

(一)MIMIC数据库

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重症监护医疗信息库是一个免费的大型数据库,其中包含重症患者的临床数据、高分辨率生理数据、死亡数据等健康相关数据。

MIMIC数据库收集了BIDMC 20016月至201210ICU收治的53423例成年患者数据和2001年至2008年收治的7870例新生儿重症患者数据。MIMIC Ⅳ数据库在MIMIC Ⅲ的基础上做了一些改进,包括数据更新和部分表格重构,收集了20082019BIDMC收治的超过19万名患者、45万次住院记录的临床数据。

MIMIC数据库包含信息如人口统计学特征、床边生命体征的测量,实验室测试结果,各种操作、药物、影像报告和死亡指标。

MIMIC数据库的主要目标是记录ICU患者的综合医疗信息,而非专门针对某一类疾病,但由于它包含的数据量庞大且覆盖面广,包含了大量癌症患者的相关数据。

(二)SEER数据库

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美国国家癌症研究所监测,流行病学和最终结果数据库,简称SEER数据库,美国癌症统计的权威来源。收录了大量的临床肿瘤回顾性研究资料,数据获取便捷并且公开免费,因而深受科研工作者的喜爱,以SEER数据库为数据来源的SCI文章正逐年增长。

SEER数据库收录的肿瘤划分为9类:乳腺、结肠&直肠、其他消化系统、女性生殖、淋巴&白血病、男性生殖、呼吸系统、泌尿系统及其它尚未确定的类型。临床数据记录包括患者的注册编号、人口统计学特征、肿瘤特征、治疗方案、死亡原因等信息。

SEER数据库核心在于其对各种癌症类型的长期跟踪和全面统计,提供了一个多层次的、细致的癌症数据集合。

SEER数据库的数据非常详尽,包括患者的基本信息、肿瘤的诊断信息、治疗方式和随访信息。研究人员可以通过这些数据进行多维度的分析,揭示不同人群中癌症发病率和生存状况的差异,帮助识别出可能的风险因素和预防策略。SEER成为研究癌症流行病学的重要工具。

(三)NHANES数据库

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美国国家健康及营养普查数据库,是一项基于全美各层次人群的横断面调查。NHANES数据库提供了所有研究对象的人口学数据、饮食数据、体格检查数据、实验室数据、及问卷调查数据。

NHANES数据库开始于80年代,每年对美国各地约 5000 人进行抽样调查。生物样本包含了参与者的血清,血浆,尿液等,涉及多种测量指标。

NHANES数据库适合大部分临床科室,通过对这些数据的排列组合,足够发很多篇SCI

NHANES数据库包括人口统计学、社会经济学、饮食和健康相关问题;体检部分包括 基础医疗信息,包括血压,测听检查、口腔健康、握力等等以及大量的实验室检测数据及部分放射科数据。

NHANES 临床数据库几乎适合大部分的临床科室,各大内科、口腔科、眼科、检验科、儿科、妇科、生殖科、肿瘤科、心血管科等。这些数据可以用于研究癌症的流行率、风险因素以及与其他健康指标的关系。

NHANES 数据库拥有庞大的数据资源,并且完全开放免费下载,该数据库包括人口统计学数据、饮食数据、 检查数据、实验室数据、问卷数据、有限访问数据,这个数据库两年更新一次,会加入很多新数据,样本量充足。

中国社科教育培训中心http://www.cssttcec.org.cn 联合工业与信息化技术培训网http://www.itcc.ac.cn 特举办“临床科研公共平台NHANES、SEER、MIMIC数据库SCI实战应用培训班”。

、培训时间:    

20241108— 20241111   远程在线培训

            (第一天数据及操作软件调试,共授课三天)


、培训目标:

 1,掌握MIMICNHANES、SEER数据库的统计分析技巧、提升统计学分析和论文写作能力,以及培养实际科研应用能力。

2,通过提供统计学分析和论文写作的套路,帮助学员快速模仿和复现相应的文章,从而提升自己的写作能力为撰写高质量的学术论文或研究报告打下坚实的基础。

3,培养医务人员利用临床大数据进行临床研究的能力,尤其是实际操作能力。

4,能够熟悉MIMICNHANES、SEER数据库的结构、数据字段、以及数据访问方法,从而能够更有效地利用该数据库进行医疗相关的研究,如疾病预测、治疗效果评估等‌

、参加对象:

全国三甲医院、医学研究所及高校从事临床医学、生物医学研究的临床医生、副主任医师、主任医师及临床医学博士、硕士研究生;

各科室肿瘤科、神经科、乳腺科、肝胆科、骨科、胃肠外科、血液科、皮肤科、肾内科、免疫科、妇产科、生殖科、心外科、神经内科、感染科、医技科等临床医生。

、主讲专家:

来自清华大学、上海交通大学、中国科学院等高校医学生物信息学学科带头人、擅长医学数据统计分析、多组学、生物医学大数据挖掘。发表数十篇专业领域内学术论文及SCI论文,主编或参与编写多部著作。参与多家三甲医院临床生物信息学的研究合作,科研及授课经验很丰富。

、课程大纲

一、临床数据分析科研方法学基础

1.常见临床SCI文章类型

2.临床研究分类

3.临床研究统计学基础

4.混杂因素与交互作用

5.临床研究回归分析

6.倾向性评分匹配(PSM)

7.危险因素研究

8.临床预测模型

9.临床工具变量回归

10.广义相加混合模型

二、临床数据分析R语言基础

1.R语言的数据结构

2.R语言的基本操作

3.R语言中外部数据的导入

4.R语言的基本统计

5.R语言的基础绘图

三、MIMIC数据库

1.MIMIC数据下载

2.MIMIC 数据提取

3.MIMIC 数据合并

4.MIMIC数据预处理

5.基于MIMIC数据的预测模型构建

6.基于MIMIC数据的机器学习

7.基于MIMIC数据的边缘结构模型

8.基于MIMIC数据的因果中介效应

9.基于MIMIC数据的潜类别分析

10.MIMIC数据库文献解析与实现

四、NHANES数据库

 

1.NHANES数据库介绍

2.NHANES数据库权重的选择

3.NHANES数据变量介绍及筛选

4.NHANES数据过滤合并权重处理

5.NHANES数据加权统计分析

6.NHANES数据加权线性回归

7.NHANES数据加权亚组分析

8.NHANES生存数据获取及相关分析

9.NHANES数据敏感性分析

10.NHANES数据库文献解析与实现

五、SEER数据库

1.SEER数据库简介

2.SEER数据库申请

3.SEER数据库数据提取

4.SEER数据预处理

5.SEER数据PSM

6.SEER数据工具变

7.SEER数据病例对照

8.SEER数据预测模型

9.SEER数据Joinpoint回归

10.SEER数据库文献解析与实现

六、高分SCI论文方法复现实战

NHANES、SEER、MIMIC数据库

1.电子病历数据集的研究热点和趋势分析

2.急性心肌梗死患者预后的预测价值

3.探讨预后营养指数与重症肝硬化患者预后的相关性

4.慢性肾脏病患者血清与全因死亡和心血管疾病死亡的相关性

5.成年人膳食模式与慢性肾脏病的关联性分析

6.探究金属与代谢性疾病的关联及炎症的中介作用

7.抑郁症与骨质疏松症之间的关联研究

8.脂肪指数与脑卒中的潜在关联

9.子宫内膜癌临床病理特征及预后列线图的构建与验证

10.原发肝细胞癌风险模型的建立与验证

11.肾乳头状细胞癌患者术后生存预测模型的开发和验证

七、SCI文章写作与投稿

1.顶刊SCI的写作

1)Backgroud/Introduction的写法(5个要素)

2)Methods的写法(7个方面)

3)Results的写法(6个分项)

4)Discussion的写法(7个层次)

2.顶刊SCI文章的选题

立题前需要考虑的10个问题

3.投稿建议

1)4个忠告

2)5个档次

八、辅助课程

1.学后交流、微信群、QQ群建立;

2.咨询、合作。

3.专业技术团队深入探讨。

课程成果实例 

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、培训费用:(注:可转账、公务卡扫码支付。正规会议通知、发票。

   A,每人4300元(含培训费、教材费、证书费、资料费)

 B,每人4980元(含培训费、教材费、证书费、资料费)

、颁发证书:参加相关培训并通过考试的学员,可以获得:

A类,中国社科教育培训中心颁发的医学公共数据库工程师(高级)专业人才技能证书,官方网站查询,该证书可作为有关单位专业技术人员能力评价、考核和任职的重要依据。

B类,工业和信息化全国工业与信息技术考试管理中心颁发的大数据分析工程师职业技能证书官方网站官方网站查询或扫描证书上方的二维码查询证书直接纳入专业人才数据库,该证书可作为企事业单位选拔和聘用专业人才的依据。(加上A类共两本证书)

注:请学员带两寸彩照两张(背面注明姓名)、身份证复印件和学历证明复印件各两张。


九、联系方式:

联系人:  毛泽璇(老师)           

手机(微信同号):13311241619





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